Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NrlP54846 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NrlP54846 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NrlP54846 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrlP54846 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrlP54846 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrlP54846 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrlP54846 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrlP54846 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrlP54846 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrlP54846 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrlP54846 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrlP54846 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NrlP54846 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrlP54846 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrlP54846 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrlP54846 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrlP54846 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrlP54846 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrlP54846 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrlP54846 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrlP54846 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NrlP54846 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrlP54846 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrlP54846 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NrlP54846 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrlP54846 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrlP54846 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrlP54846 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrlP54846 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrlP54846 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NrlP54846 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrlP54846 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrlP54846 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrlP54846 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrlP54846 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrlP54846 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrlP54846 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrlP54846 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrlP54846 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrlP54846 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrlP54846 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NrlP54846 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NrlP54846 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NrlP54846 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NrlP54846 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NrlP54846 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NrlP54846 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NrlP54846 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NrlP54846 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NrlP54846 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NrlP54846 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NrlP54846 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NrlP54846 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NrlP54846 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NrlP54846 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NrlP54846 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NrlP54846 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NrlP54846 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NrlP54846 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NrlP54846 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NrlP54846 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NrlP54846 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NrlP54846 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NrlP54846 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NrlP54846 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NrlP54846 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NrlP54846 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NrlP54846 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NrlP54846 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NrlP54846 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NrlP54846 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrlP54846 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrlP54846 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NrlP54846 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrlP54846 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrlP54846 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrlP54846 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrlP54846 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrlP54846 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrlP54846 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrlP54846 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrlP54846 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrlP54846 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrlP54846 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrlP54846 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrlP54846 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms