Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp1P52624 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp1P52624 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp1P52624 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Upp1P52624 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upp1P52624 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Upp1P52624 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Upp1P52624 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Upp1P52624 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.2 ms