Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccr1P51675 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr1P51675 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms