Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpc4P51655 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms