Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrp3P50462 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms