Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC10P48553 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms