Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd4P46935 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nedd4P46935 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms