Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brcc3P46737 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brcc3P46737 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms