Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFRP42898 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms