Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms