Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPA3P35244 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPA3P35244 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPA3P35244 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPA3P35244 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPA3P35244 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPA3P35244 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPA3P35244 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPA3P35244 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPA3P35244 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPA3P35244 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPA3P35244 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPA3P35244 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPA3P35244 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPA3P35244 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPA3P35244 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPA3P35244 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPA3P35244 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPA3P35244 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPA3P35244 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPA3P35244 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPA3P35244 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPA3P35244 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA3P35244 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA3P35244 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA3P35244 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA3P35244 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA3P35244 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA3P35244 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA3P35244 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA3P35244 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA3P35244 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA3P35244 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA3P35244 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA3P35244 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA3P35244 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA3P35244 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA3P35244 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA3P35244 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPA3P35244 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPA3P35244 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPA3P35244 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPA3P35244 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPA3P35244 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPA3P35244 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA3P35244 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA3P35244 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA3P35244 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA3P35244 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA3P35244 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA3P35244 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA3P35244 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA3P35244 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA3P35244 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA3P35244 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA3P35244 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA3P35244 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA3P35244 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA3P35244 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA3P35244 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA3P35244 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA3P35244 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA3P35244 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPA3P35244 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPA3P35244 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPA3P35244 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPA3P35244 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPA3P35244 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPA3P35244 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPA3P35244 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPA3P35244 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA3P35244 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA3P35244 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA3P35244 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA3P35244 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA3P35244 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA3P35244 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA3P35244 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA3P35244 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA3P35244 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA3P35244 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA3P35244 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA3P35244 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA3P35244 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA3P35244 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA3P35244 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPA3P35244 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPA3P35244 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms