Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn11P35235 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms