Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCD1P33897 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCD1P33897 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms