Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pola1P33609 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pola1P33609 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pola1P33609 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pola1P33609 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pola1P33609 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pola1P33609 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pola1P33609 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pola1P33609 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pola1P33609 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pola1P33609 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pola1P33609 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pola1P33609 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pola1P33609 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pola1P33609 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pola1P33609 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pola1P33609 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pola1P33609 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Pola1P33609 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms