Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA6P31267 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms