Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BgnP28653 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BgnP28653 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BgnP28653 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BgnP28653 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BgnP28653 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BgnP28653 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BgnP28653 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BgnP28653 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BgnP28653 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BgnP28653 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BgnP28653 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BgnP28653 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BgnP28653 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BgnP28653 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BgnP28653 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BgnP28653 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BgnP28653 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BgnP28653 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BgnP28653 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BgnP28653 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BgnP28653 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BgnP28653 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BgnP28653 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BgnP28653 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BgnP28653 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BgnP28653 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BgnP28653 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BgnP28653 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BgnP28653 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BgnP28653 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BgnP28653 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BgnP28653 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BgnP28653 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BgnP28653 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BgnP28653 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BgnP28653 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BgnP28653 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BgnP28653 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BgnP28653 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BgnP28653 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BgnP28653 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BgnP28653 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BgnP28653 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BgnP28653 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BgnP28653 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BgnP28653 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BgnP28653 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BgnP28653 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BgnP28653 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BgnP28653 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BgnP28653 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BgnP28653 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BgnP28653 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BgnP28653 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BgnP28653 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BgnP28653 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BgnP28653 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BgnP28653 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms