Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IppP28575 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IppP28575 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IppP28575 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IppP28575 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IppP28575 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IppP28575 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IppP28575 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IppP28575 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IppP28575 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IppP28575 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IppP28575 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IppP28575 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IppP28575 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IppP28575 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IppP28575 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IppP28575 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IppP28575 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IppP28575 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IppP28575 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IppP28575 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IppP28575 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IppP28575 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IppP28575 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IppP28575 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IppP28575 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IppP28575 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IppP28575 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IppP28575 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IppP28575 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IppP28575 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IppP28575 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IppP28575 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IppP28575 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IppP28575 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IppP28575 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IppP28575 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IppP28575 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IppP28575 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IppP28575 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IppP28575 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IppP28575 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IppP28575 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IppP28575 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IppP28575 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IppP28575 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IppP28575 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IppP28575 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IppP28575 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IppP28575 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IppP28575 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IppP28575 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IppP28575 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IppP28575 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IppP28575 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IppP28575 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IppP28575 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IppP28575 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IppP28575 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IppP28575 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IppP28575 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IppP28575 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IppP28575 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IppP28575 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IppP28575 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IppP28575 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IppP28575 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IppP28575 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IppP28575 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IppP28575 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IppP28575 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IppP28575 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IppP28575 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IppP28575 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IppP28575 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IppP28575 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IppP28575 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IppP28575 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IppP28575 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IppP28575 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IppP28575 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IppP28575 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IppP28575 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IppP28575 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IppP28575 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IppP28575 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IppP28575 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IppP28575 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.8 ms