Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrcc6P23475 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xrcc6P23475 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.2 ms