Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPAP23025 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPAP23025 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPAP23025 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPAP23025 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPAP23025 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPAP23025 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPAP23025 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPAP23025 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPAP23025 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XPAP23025 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPAP23025 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPAP23025 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPAP23025 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPAP23025 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPAP23025 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPAP23025 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPAP23025 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPAP23025 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPAP23025 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPAP23025 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPAP23025 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPAP23025 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPAP23025 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPAP23025 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPAP23025 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPAP23025 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
XPAP23025 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
XPAP23025 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPAP23025 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPAP23025 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPAP23025 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPAP23025 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPAP23025 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPAP23025 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPAP23025 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPAP23025 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPAP23025 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPAP23025 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
XPAP23025 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPAP23025 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XPAP23025 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPAP23025 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPAP23025 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPAP23025 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPAP23025 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPAP23025 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPAP23025 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPAP23025 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPAP23025 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPAP23025 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPAP23025 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPAP23025 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPAP23025 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPAP23025 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPAP23025 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPAP23025 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPAP23025 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPAP23025 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPAP23025 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPAP23025 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPAP23025 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms