Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS4Y1P22090 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4Y1P22090 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4Y1P22090 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4Y1P22090 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4Y1P22090 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4Y1P22090 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4Y1P22090 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS4Y1P22090 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS4Y1P22090 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms