Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb9P20615 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms