Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A1P19634 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms