Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ms4a1P19437 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a1P19437 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms