Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefhP19246 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefhP19246 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefhP19246 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefhP19246 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefhP19246 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefhP19246 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefhP19246 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefhP19246 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefhP19246 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefhP19246 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefhP19246 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NefhP19246 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefhP19246 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefhP19246 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NefhP19246 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefhP19246 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefhP19246 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefhP19246 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NefhP19246 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NefhP19246 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NefhP19246 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NefhP19246 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NefhP19246 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefhP19246 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefhP19246 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefhP19246 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefhP19246 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefhP19246 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefhP19246 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefhP19246 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefhP19246 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NefhP19246 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefhP19246 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NefhP19246 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefhP19246 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefhP19246 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefhP19246 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefhP19246 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NefhP19246 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefhP19246 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefhP19246 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefhP19246 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NefhP19246 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefhP19246 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefhP19246 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefhP19246 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefhP19246 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NefhP19246 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefhP19246 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NefhP19246 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefhP19246 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefhP19246 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NefhP19246 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefhP19246 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefhP19246 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefhP19246 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefhP19246 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NefhP19246 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefhP19246 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefhP19246 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefhP19246 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefhP19246 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefhP19246 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefhP19246 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefhP19246 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefhP19246 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NefhP19246 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefhP19246 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefhP19246 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefhP19246 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefhP19246 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefhP19246 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefhP19246 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefhP19246 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefhP19246 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefhP19246 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefhP19246 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefhP19246 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefhP19246 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefhP19246 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefhP19246 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefhP19246 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefhP19246 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefhP19246 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefhP19246 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefhP19246 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefhP19246 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefhP19246 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefhP19246 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefhP19246 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NefhP19246 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefhP19246 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NefhP19246 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefhP19246 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefhP19246 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefhP19246 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefhP19246 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefhP19246 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefhP19246 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms