Protein–RNA interactions for Protein: P16372

Zfp58, Zinc finger protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp58P16372 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zfp58P16372 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp58P16372 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp58P16372 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms