Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NCK1P16333 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCK1P16333 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCK1P16333 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCK1P16333 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCK1P16333 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCK1P16333 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCK1P16333 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCK1P16333 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCK1P16333 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCK1P16333 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCK1P16333 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCK1P16333 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCK1P16333 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCK1P16333 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCK1P16333 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCK1P16333 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCK1P16333 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCK1P16333 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCK1P16333 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCK1P16333 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCK1P16333 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCK1P16333 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCK1P16333 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NCK1P16333 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCK1P16333 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCK1P16333 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCK1P16333 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCK1P16333 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCK1P16333 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCK1P16333 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NCK1P16333 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCK1P16333 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCK1P16333 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCK1P16333 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCK1P16333 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCK1P16333 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCK1P16333 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCK1P16333 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCK1P16333 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCK1P16333 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCK1P16333 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCK1P16333 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCK1P16333 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCK1P16333 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCK1P16333 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCK1P16333 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCK1P16333 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCK1P16333 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCK1P16333 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCK1P16333 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCK1P16333 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCK1P16333 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCK1P16333 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCK1P16333 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCK1P16333 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCK1P16333 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCK1P16333 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCK1P16333 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCK1P16333 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCK1P16333 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCK1P16333 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NCK1P16333 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCK1P16333 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCK1P16333 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCK1P16333 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCK1P16333 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCK1P16333 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCK1P16333 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCK1P16333 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCK1P16333 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCK1P16333 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCK1P16333 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCK1P16333 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCK1P16333 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCK1P16333 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCK1P16333 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCK1P16333 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCK1P16333 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCK1P16333 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCK1P16333 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCK1P16333 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCK1P16333 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCK1P16333 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCK1P16333 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCK1P16333 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCK1P16333 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms