Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGB4P16144 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms