Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTHFD2P13995 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD2P13995 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms