Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh3P13705 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh3P13705 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msh3P13705 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh3P13705 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh3P13705 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh3P13705 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh3P13705 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh3P13705 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms