Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCG2P13521 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCG2P13521 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCG2P13521 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCG2P13521 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCG2P13521 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCG2P13521 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCG2P13521 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCG2P13521 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCG2P13521 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCG2P13521 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCG2P13521 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCG2P13521 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCG2P13521 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCG2P13521 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCG2P13521 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCG2P13521 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCG2P13521 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG2P13521 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG2P13521 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG2P13521 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG2P13521 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG2P13521 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG2P13521 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG2P13521 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG2P13521 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCG2P13521 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCG2P13521 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCG2P13521 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCG2P13521 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCG2P13521 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCG2P13521 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCG2P13521 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG2P13521 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG2P13521 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG2P13521 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG2P13521 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG2P13521 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG2P13521 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG2P13521 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG2P13521 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG2P13521 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCG2P13521 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCG2P13521 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCG2P13521 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCG2P13521 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCG2P13521 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCG2P13521 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCG2P13521 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCG2P13521 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCG2P13521 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCG2P13521 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCG2P13521 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCG2P13521 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCG2P13521 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG2P13521 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG2P13521 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG2P13521 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG2P13521 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG2P13521 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG2P13521 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG2P13521 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG2P13521 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG2P13521 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG2P13521 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCG2P13521 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCG2P13521 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCG2P13521 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCG2P13521 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCG2P13521 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCG2P13521 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCG2P13521 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCG2P13521 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCG2P13521 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCG2P13521 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCG2P13521 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCG2P13521 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCG2P13521 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCG2P13521 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCG2P13521 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCG2P13521 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCG2P13521 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCG2P13521 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG2P13521 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG2P13521 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG2P13521 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG2P13521 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG2P13521 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG2P13521 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG2P13521 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG2P13521 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG2P13521 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG2P13521 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG2P13521 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG2P13521 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCG2P13521 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCG2P13521 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCG2P13521 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCG2P13521 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SCG2P13521 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms