Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMP2P13473 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMP2P13473 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMP2P13473 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMP2P13473 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMP2P13473 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMP2P13473 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMP2P13473 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMP2P13473 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMP2P13473 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMP2P13473 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMP2P13473 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMP2P13473 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMP2P13473 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAMP2P13473 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms