Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms