Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RARBP10826 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RARBP10826 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RARBP10826 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RARBP10826 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RARBP10826 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RARBP10826 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RARBP10826 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RARBP10826 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RARBP10826 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RARBP10826 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RARBP10826 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RARBP10826 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RARBP10826 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RARBP10826 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARBP10826 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARBP10826 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RARBP10826 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RARBP10826 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RARBP10826 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARBP10826 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARBP10826 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARBP10826 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARBP10826 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RARBP10826 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARBP10826 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARBP10826 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARBP10826 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARBP10826 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RARBP10826 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RARBP10826 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARBP10826 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARBP10826 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARBP10826 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RARBP10826 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RARBP10826 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RARBP10826 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RARBP10826 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RARBP10826 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RARBP10826 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RARBP10826 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RARBP10826 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RARBP10826 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RARBP10826 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RARBP10826 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RARBP10826 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RARBP10826 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RARBP10826 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RARBP10826 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RARBP10826 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RARBP10826 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RARBP10826 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RARBP10826 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARBP10826 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARBP10826 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARBP10826 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARBP10826 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARBP10826 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RARBP10826 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARBP10826 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RARBP10826 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARBP10826 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARBP10826 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARBP10826 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARBP10826 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARBP10826 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARBP10826 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARBP10826 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARBP10826 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARBP10826 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARBP10826 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARBP10826 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARBP10826 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARBP10826 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARBP10826 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARBP10826 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARBP10826 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARBP10826 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARBP10826 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARBP10826 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARBP10826 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RARBP10826 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARBP10826 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARBP10826 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARBP10826 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARBP10826 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RARBP10826 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARBP10826 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RARBP10826 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RARBP10826 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RARBP10826 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARBP10826 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARBP10826 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RARBP10826 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARBP10826 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARBP10826 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARBP10826 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARBP10826 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARBP10826 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RARBP10826 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms