Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GLI4P10075 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GLI4P10075 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GLI4P10075 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GLI4P10075 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI4P10075 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI4P10075 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI4P10075 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI4P10075 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI4P10075 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI4P10075 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI4P10075 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI4P10075 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI4P10075 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI4P10075 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI4P10075 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI4P10075 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI4P10075 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI4P10075 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI4P10075 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI4P10075 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI4P10075 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI4P10075 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI4P10075 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI4P10075 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI4P10075 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI4P10075 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI4P10075 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI4P10075 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI4P10075 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GLI4P10075 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GLI4P10075 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GLI4P10075 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GLI4P10075 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GLI4P10075 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GLI4P10075 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GLI4P10075 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GLI4P10075 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GLI4P10075 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GLI4P10075 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GLI4P10075 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GLI4P10075 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLI4P10075 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLI4P10075 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GLI4P10075 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLI4P10075 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GLI4P10075 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLI4P10075 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLI4P10075 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLI4P10075 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLI4P10075 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLI4P10075 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLI4P10075 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GLI4P10075 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLI4P10075 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GLI4P10075 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLI4P10075 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLI4P10075 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLI4P10075 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLI4P10075 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLI4P10075 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLI4P10075 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLI4P10075 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLI4P10075 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLI4P10075 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GLI4P10075 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLI4P10075 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GLI4P10075 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GLI4P10075 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GLI4P10075 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GLI4P10075 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms