Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMIM10L2BP0DMW5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM10L2BP0DMW5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM10L2BP0DMW5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms