Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Becn2P0DM65 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Becn2P0DM65 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms