Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LINC00271P0C7V0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00271P0C7V0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms