Protein–RNA interactions for Protein: P0C242

Ccno, Cyclin-O, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnoP0C242 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CcnoP0C242 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcnoP0C242 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms