Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP3P08254 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP3P08254 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP3P08254 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP3P08254 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP3P08254 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP3P08254 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP3P08254 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP3P08254 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP3P08254 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP3P08254 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP3P08254 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP3P08254 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP3P08254 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP3P08254 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP3P08254 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP3P08254 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP3P08254 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP3P08254 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP3P08254 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP3P08254 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP3P08254 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP3P08254 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP3P08254 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP3P08254 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP3P08254 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP3P08254 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP3P08254 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP3P08254 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP3P08254 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP3P08254 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP3P08254 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP3P08254 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP3P08254 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP3P08254 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP3P08254 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP3P08254 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP3P08254 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP3P08254 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP3P08254 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP3P08254 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MMP3P08254 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MMP3P08254 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP3P08254 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP3P08254 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP3P08254 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP3P08254 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP3P08254 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP3P08254 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP3P08254 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP3P08254 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP3P08254 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP3P08254 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP3P08254 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP3P08254 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP3P08254 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP3P08254 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP3P08254 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP3P08254 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP3P08254 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP3P08254 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP3P08254 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP3P08254 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP3P08254 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP3P08254 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP3P08254 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP3P08254 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP3P08254 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP3P08254 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP3P08254 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP3P08254 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP3P08254 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP3P08254 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP3P08254 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP3P08254 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP3P08254 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP3P08254 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP3P08254 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP3P08254 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP3P08254 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP3P08254 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP3P08254 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP3P08254 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP3P08254 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP3P08254 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP3P08254 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP3P08254 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP3P08254 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP3P08254 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP3P08254 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP3P08254 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP3P08254 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP3P08254 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP3P08254 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP3P08254 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP3P08254 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP3P08254 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP3P08254 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP3P08254 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP3P08254 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms