Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPP08247 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPP08247 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPP08247 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPP08247 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPP08247 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPP08247 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPP08247 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPP08247 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPP08247 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPP08247 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPP08247 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPP08247 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPP08247 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPP08247 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPP08247 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPP08247 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPP08247 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPP08247 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPP08247 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPP08247 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPP08247 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPP08247 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYPP08247 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYPP08247 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYPP08247 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYPP08247 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYPP08247 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYPP08247 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPP08247 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPP08247 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPP08247 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPP08247 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPP08247 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPP08247 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYPP08247 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYPP08247 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYPP08247 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPP08247 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPP08247 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPP08247 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPP08247 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPP08247 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPP08247 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYPP08247 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYPP08247 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYPP08247 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYPP08247 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYPP08247 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPP08247 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPP08247 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPP08247 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPP08247 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPP08247 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPP08247 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPP08247 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPP08247 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYPP08247 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYPP08247 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYPP08247 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYPP08247 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYPP08247 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYPP08247 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPP08247 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPP08247 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPP08247 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPP08247 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPP08247 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPP08247 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPP08247 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPP08247 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPP08247 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPP08247 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPP08247 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYPP08247 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYPP08247 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYPP08247 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYPP08247 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYPP08247 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYPP08247 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPP08247 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPP08247 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPP08247 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPP08247 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPP08247 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPP08247 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPP08247 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPP08247 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms