Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC3A2P08195 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC3A2P08195 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC3A2P08195 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC3A2P08195 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC3A2P08195 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC3A2P08195 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC3A2P08195 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC3A2P08195 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC3A2P08195 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC3A2P08195 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC3A2P08195 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC3A2P08195 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC3A2P08195 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC3A2P08195 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC3A2P08195 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC3A2P08195 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC3A2P08195 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC3A2P08195 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC3A2P08195 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC3A2P08195 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC3A2P08195 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC3A2P08195 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC3A2P08195 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC3A2P08195 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC3A2P08195 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC3A2P08195 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC3A2P08195 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC3A2P08195 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC3A2P08195 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC3A2P08195 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC3A2P08195 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC3A2P08195 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC3A2P08195 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC3A2P08195 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC3A2P08195 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC3A2P08195 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC3A2P08195 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC3A2P08195 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC3A2P08195 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC3A2P08195 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC3A2P08195 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC3A2P08195 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC3A2P08195 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC3A2P08195 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC3A2P08195 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC3A2P08195 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC3A2P08195 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms