Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB1P08034 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB1P08034 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB1P08034 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB1P08034 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB1P08034 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB1P08034 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB1P08034 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB1P08034 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB1P08034 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB1P08034 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB1P08034 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB1P08034 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB1P08034 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB1P08034 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB1P08034 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB1P08034 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB1P08034 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB1P08034 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB1P08034 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB1P08034 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB1P08034 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB1P08034 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB1P08034 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB1P08034 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB1P08034 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB1P08034 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB1P08034 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB1P08034 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB1P08034 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB1P08034 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB1P08034 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB1P08034 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB1P08034 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB1P08034 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB1P08034 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB1P08034 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB1P08034 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB1P08034 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB1P08034 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB1P08034 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB1P08034 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB1P08034 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB1P08034 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB1P08034 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB1P08034 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB1P08034 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB1P08034 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB1P08034 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB1P08034 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB1P08034 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB1P08034 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB1P08034 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB1P08034 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB1P08034 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB1P08034 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB1P08034 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB1P08034 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB1P08034 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB1P08034 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB1P08034 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB1P08034 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB1P08034 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB1P08034 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB1P08034 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB1P08034 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB1P08034 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB1P08034 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB1P08034 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB1P08034 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB1P08034 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB1P08034 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB1P08034 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB1P08034 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB1P08034 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB1P08034 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB1P08034 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB1P08034 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB1P08034 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB1P08034 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB1P08034 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB1P08034 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB1P08034 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB1P08034 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB1P08034 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB1P08034 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB1P08034 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJB1P08034 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJB1P08034 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB1P08034 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB1P08034 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB1P08034 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB1P08034 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB1P08034 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB1P08034 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB1P08034 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB1P08034 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB1P08034 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB1P08034 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB1P08034 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms