Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me1P06801 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me1P06801 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me1P06801 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me1P06801 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me1P06801 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me1P06801 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Me1P06801 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Me1P06801 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Me1P06801 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Me1P06801 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Me1P06801 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Me1P06801 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Me1P06801 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Me1P06801 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Me1P06801 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Me1P06801 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Me1P06801 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Me1P06801 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Me1P06801 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Me1P06801 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Me1P06801 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Me1P06801 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Me1P06801 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me1P06801 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me1P06801 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me1P06801 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me1P06801 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me1P06801 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Me1P06801 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me1P06801 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me1P06801 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Me1P06801 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Me1P06801 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Me1P06801 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Me1P06801 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Me1P06801 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Me1P06801 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Me1P06801 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Me1P06801 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Me1P06801 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Me1P06801 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me1P06801 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me1P06801 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me1P06801 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me1P06801 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me1P06801 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me1P06801 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me1P06801 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Me1P06801 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me1P06801 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me1P06801 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me1P06801 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me1P06801 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me1P06801 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me1P06801 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me1P06801 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me1P06801 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me1P06801 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me1P06801 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me1P06801 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me1P06801 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Me1P06801 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Me1P06801 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Me1P06801 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Me1P06801 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Me1P06801 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Me1P06801 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Me1P06801 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Me1P06801 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Me1P06801 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Me1P06801 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Me1P06801 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Me1P06801 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Me1P06801 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Me1P06801 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Me1P06801 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Me1P06801 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Me1P06801 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Me1P06801 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Me1P06801 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Me1P06801 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Me1P06801 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Me1P06801 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Me1P06801 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Me1P06801 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me1P06801 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me1P06801 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me1P06801 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me1P06801 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me1P06801 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me1P06801 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me1P06801 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Me1P06801 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Me1P06801 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Me1P06801 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Me1P06801 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Me1P06801 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Me1P06801 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Me1P06801 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.3 ms