Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB4AP04350 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms