Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01725 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01725 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01725 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01725 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01725 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01725 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01725 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01725 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01725 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01725 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01725 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01725 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01725 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01725 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01725 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01725 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01725 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01725 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01725 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01725 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01725 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01725 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01725 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01725 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01725 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01725 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01725 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01725 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01725 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01725 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01725 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01725 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01725 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01725 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01725 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01725 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01725 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01725 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
P01725 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01725 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01725 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01725 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
P01725 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01725 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01725 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01725 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01725 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01725 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01725 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01725 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01725 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01725 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01725 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01725 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01725 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01725 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01725 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01725 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01725 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01725 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01725 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01725 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01725 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01725 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01725 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
P01725 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01725 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01725 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01725 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01725 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01725 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01725 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01725 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01725 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01725 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01725 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01725 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01725 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01725 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01725 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01725 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01725 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01725 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01725 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01725 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01725 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms