Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01665 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01665 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01665 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01665 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01665 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01665 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01665 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01665 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01665 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01665 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01665 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01665 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01665 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01665 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01665 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01665 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01665 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01665 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01665 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01665 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01665 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01665 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01665 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01665 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01665 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01665 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01665 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01665 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01665 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
P01665 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01665 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01665 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01665 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01665 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01665 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01665 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01665 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01665 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01665 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01665 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01665 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01665 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01665 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01665 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01665 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01665 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01665 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01665 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01665 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01665 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01665 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01665 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01665 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01665 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01665 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01665 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01665 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01665 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01665 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P01665 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P01665 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01665 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P01665 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01665 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01665 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01665 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01665 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01665 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01665 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01665 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01665 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01665 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01665 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01665 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
P01665 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01665 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01665 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01665 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01665 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01665 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01665 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01665 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01665 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01665 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01665 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01665 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01665 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01665 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01665 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01665 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
P01665 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01665 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01665 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01665 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01665 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01665 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01665 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01665 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01665 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms