Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01664 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01664 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01664 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01664 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01664 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01664 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01664 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01664 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01664 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01664 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01664 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01664 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01664 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01664 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01664 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01664 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01664 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01664 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
P01664 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01664 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01664 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01664 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
P01664 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01664 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01664 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01664 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01664 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01664 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01664 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01664 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01664 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01664 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01664 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01664 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01664 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01664 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01664 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01664 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01664 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01664 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01664 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01664 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01664 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01664 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01664 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01664 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01664 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01664 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01664 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01664 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01664 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01664 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01664 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01664 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01664 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01664 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01664 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01664 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01664 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01664 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01664 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01664 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01664 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01664 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01664 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01664 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms