Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB6O95452 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB6O95452 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB6O95452 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB6O95452 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB6O95452 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB6O95452 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB6O95452 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB6O95452 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB6O95452 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB6O95452 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB6O95452 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB6O95452 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB6O95452 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB6O95452 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB6O95452 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB6O95452 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB6O95452 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB6O95452 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB6O95452 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB6O95452 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB6O95452 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB6O95452 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB6O95452 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB6O95452 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB6O95452 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB6O95452 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB6O95452 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB6O95452 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB6O95452 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB6O95452 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB6O95452 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB6O95452 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB6O95452 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB6O95452 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB6O95452 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB6O95452 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB6O95452 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB6O95452 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB6O95452 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB6O95452 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB6O95452 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB6O95452 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB6O95452 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB6O95452 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB6O95452 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB6O95452 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB6O95452 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB6O95452 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB6O95452 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB6O95452 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB6O95452 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB6O95452 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB6O95452 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB6O95452 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB6O95452 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB6O95452 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB6O95452 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB6O95452 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB6O95452 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB6O95452 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB6O95452 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB6O95452 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB6O95452 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB6O95452 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB6O95452 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB6O95452 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB6O95452 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB6O95452 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB6O95452 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB6O95452 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB6O95452 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB6O95452 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB6O95452 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB6O95452 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB6O95452 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB6O95452 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB6O95452 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB6O95452 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB6O95452 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB6O95452 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB6O95452 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB6O95452 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB6O95452 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB6O95452 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB6O95452 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB6O95452 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185 ms