Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCA5LO95447 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LCA5LO95447 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms