Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Setdb1O88974 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms